A Unidade foi inaugurada oficialmente em 1972, ainda que os trabalhos sociais de apoio ao território tenham começado antes. No início década de 1970, a Colônia Espírita Seara do Mestre realizava importantes tarefas de amparo à infância em Periperi, graças à doação de um terreno por um benfeitor chamado Antônio Carlos de Oliveira Pinto.
Em uma de suas visitas a Salvador, o então presidente do Lar Fabiano de Cristo, Jaime Rolemberg, tomou conhecimento do trabalho e propôs à Diretoria da Colônia Espírita uma parceria. Em 1973, a recém-inaugurada Unidade foi transferida para outra localidade no território, onde reside até hoje, agora administrada diretamente pelo LFC.
O nome da Unidade foi escolhido por Jaime Rolemberg em homenagem a uma importante médium de nome Eugênia, citada por Chico Xavier em um de seus livros.
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